Výzkumná činnost, seznam publikací

Zde je dosavadní kompletní seznam mých publikovaných prací v impaktovaných časopisech.

Nejnovější sada publikací se týká proteomického výzkumu neuroendokrinních nádorů feochromocytomů a paragangliomů a nalezených potenciálních diagnostických či terapeutických cílů.

Dřívější práce jsou zaměřené metodicky, a týkají se vývoje postupu pro proteomickou analýzu zaměřenou na membránové proteiny.

Nejstarší publikace se pak týkají výzkumu rezistence lidských B lymfomů na konkrétní typ léčiv - nukleosidových analogů.

  • Majtan, T., Olsen, T., Sokolova, J., Krijt, J., Křížková, M., Ida, T., Ditrói, T., Hansikova, H., Vit, O., Petrak, J., Kuchař, L., Kruger, W. D., Nagy, P., Akaike, T., & Kožich, V. (2024). Deciphering pathophysiological mechanisms underlying cystathionine beta-synthase-deficient homocystinuria using targeted metabolomics, liver proteomics, sphingolipidomics and analysis of mitochondrial function. Redox biology, 73, 103222. https://doi.org/10.1016/j.redox.2024.103222

  • Vít, O., Talacko, P., Musil, Z., Hartmann, I., Pacák, K., & Petrák, J. (2023). Identification of Potential Molecular Targets for the Treatment of Cluster 1 Human Pheochromocytoma and Paraganglioma via Comprehensive Proteomic Characterization. Clinical Proteomics, 20(1), 39. https://doi.org/10.1186/s12014-023-09428-7

  • Vít, O., & Petrák, J. (2023). Autotaxin and Lysophosphatidic Acid Signalling: The Pleiotropic Regulatory Network in Cancer. Folia biologica, 69(5-6), 149–162. https://doi.org/10.14712/fb2023069050149

  • Vít, O., Patel, M., Musil, Z., Hartmann, I., Fryšák, Z., Miettinen, M., Pacák, K., & Petrák, J. (2021). Deep Membrane Proteome Profiling Reveals Overexpression of Prostate-Specific Membrane Antigen (PSMA) in High-Risk Human Paraganglioma and Pheochromocytoma, Suggesting New Theranostic Opportunity. Molecules (Basel, Switzerland), 26(21), 6567. https://doi.org/10.3390/molecules26216567

  • Vít, O., Harant, K., Klener, P., Man, P., & Petrák, J. (2019). A Three-pronged "Pitchfork" Strategy Enables an Extensive Description of the Human Membrane Proteome and the Identification of Missing Proteins. Journal of Proteomics, 204, 103411. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2019.103411

  • Vít, O., & Petrák, J. (2017). Integral Membrane Proteins in Proteomics. How to Break Open the Black Box? Journal of Proteomics, 153, 8–20. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2016.08.006

  • Vít, O., Man, P., Kádek, A., Hausner, J., Sklenář, J., Harant, K., Novák, P., Ščigelová, M., Woffendin, G., & Petrák, J. (2016). Large-scale Identification of Membrane Proteins Based on Analysis of Trypsin-protected Transmembrane Segments. Journal of Proteomics, 149, 15–22. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2016.03.016

  • Toman, O., Kabíčková, T., Vít, O., Fišer, R., Poláková, K. M., Zach, J., Linhartová, J., Vyoral, D., & Petrák, J. (2016). Proteomic Analysis of Imatinib-resistant CML-T1 Cells Reveals Calcium Homeostasis as a Potential Therapeutic Target. Oncology Reports, 36(3), 1258–1268. https://doi.org/10.3892/or.2016.4945

  • Lorková, L., Ščigelová, M., Arrey, T. N., Vít, O., Pospíšilová, J., Doktorová, E., Klánová, M., Alam, M., Vočková, P., Maswabi, B., Klener, P., Jr, & Petrák, J. (2015). Detailed Functional and Proteomic Characterization of Fludarabine Resistance in Mantle Cell Lymphoma Cells. PLoS One, 10(8), e0135314. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0135314

  • Klánová, M., Lorková, L., Vít, O., Maswabi, B., Molinský, J., Pospíšilová, J., Vočková, P., Mavis, C., Latečková, L., Kulvait, V., Vejmělková, D., Jakša, R., Hernandez, F., Trněný, M., Vokurka, M., Petrák, J., & Klener, P., Jr (2014). Downregulation of Deoxycytidine Kinase in Cytarabine-resistant Mantle Cell Lymphoma Cells Confers Cross-resistance to Nucleoside Analogs Gemcitabine, Fludarabine and Cladribine, but Not to Other Classes of Anti-lymphoma Agents. Molecular Cancer, 13, 159. https://doi.org/10.1186/1476-4598-13-159

  • Pospíšilová, J., Vít, O., Lorková, L., Klánová, M., Živný, J., Klener, P., & Petrák, J. (2013). Resistance to TRAIL in Mantle Cell Lymphoma Cells is Associated With the Decreased Expression of Purine Metabolism Enzymes. International Journal of Molecular Medicine, 31(5), 1273–1279. https://doi.org/10.3892/ijmm.2013.1302

  • Petrák, J., Pospíšilová, J., Šedinová, M., Jedelský, P., Lorková, L., Vít, O., Kolář, M., Strnad, H., Beneš, J., Sedmera, D., Červenka, L., & Melenovský, V. (2011). Proteomic and Transcriptomic Analysis of Heart Failure Due to Volume Overload in a Rat Aorto-caval Fistula Model Provides Support for New Potential Therapeutic Targets - Monoamine Oxidase a and Transglutaminase 2. Proteome Science, 9(1), 69. https://doi.org/10.1186/1477-5956-9-69